Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 RNU1-106P-201ENST00000384382 164 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 AC087575.1-201ENST00000585087 229 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 DCLK1-204ENST00000379893 4612 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 RNA5SP156-201ENST00000410250 110 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 FAM160A1-203ENST00000505231 4156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 ZNF532-222ENST00000591083 5324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 AL450023.3-201ENST00000440592 271 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 MDN1-205ENST00000629399 17400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 RAPGEF4-204ENST00000409036 3975 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 ZNF33B-208ENST00000613419 5843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 SRGAP1-207ENST00000631006 8406 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.44
HOXD11P31277 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 ZNF160-202ENST00000418871 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 CCDC13-AS1-202ENST00000446950 554 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 MIR6717-201ENST00000622747 73 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 TMC7-202ENST00000421369 4499 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 SORCS1-209ENST00000612154 6862 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AL022323.4-201ENST00000623980 13120 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 RN7SL714P-201ENST00000487050 298 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 AL133284.1-201ENST00000423715 4996 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD11P31277 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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