Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,065 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 NDUFB4P10-201ENST00000452541 359 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 FTX_2.1-201ENST00000618816 94 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 RN7SL330P-201ENST00000469709 307 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 HEATR5B-201ENST00000233099 6905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 LINC01810-201ENST00000450397 411 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
NLRC3Q7RTR2 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
NLRC3Q7RTR2 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NLRC3Q7RTR2 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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