Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 MIR6867-201ENST00000610636 67 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.61□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 FAM169A-203ENST00000510496 5810 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 LINC01545-201ENST00000377879 521 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 SLC44A5-201ENST00000370855 4406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 SNORD45.3-201ENST00000363836 72 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 PLCB4-206ENST00000414679 3947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
MSMPQ1L6U9 ATF7IP2-202ENST00000356427 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms