Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 Y_RNA.720-201ENST00000517166 92 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 SYNE1-212ENST00000423061 27436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
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DDB1Q16531 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
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DDB1Q16531 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 MIR4503-201ENST00000582187 83 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNU6-463P-201ENST00000384340 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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DDB1Q16531 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
DDB1Q16531 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
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