Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 FGD4-211ENST00000531134 2924 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 RNU6-32P-201ENST00000383948 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 RNU6-13P-201ENST00000384248 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 RNU6-12P-201ENST00000384604 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 RNU6-41P-201ENST00000384741 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SCARF1Q14162 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 RNY4P29-201ENST00000410801 97 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 RNU6-1198P-201ENST00000516904 67 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 RGS5-208ENST00000530507 851 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 UBE4A-203ENST00000545354 2149 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 RPS29P4-201ENST00000414733 161 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SCARF1Q14162 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms