Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AL353689.1-201ENST00000438895 199 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RNU2-11P-201ENST00000459191 187 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RNU6-513P-201ENST00000516104 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 HIF1AN-201ENST00000299163 13011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
MKRN4PQ13434 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 RFFL-202ENST00000394597 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 N4BP2L2-IT2-201ENST00000629393 4890 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 CNTN1-208ENST00000551295 5557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 USP8P1-201ENST00000494673 3183 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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MKRN4PQ13434 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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MKRN4PQ13434 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 AL360270.2-201ENST00000562952 5985 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 SPATA5-201ENST00000274008 8137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
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MKRN4PQ13434 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 DSPP-202ENST00000399271 4331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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MKRN4PQ13434 Y_RNA.531-201ENST00000384589 121 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 AC092490.3-201ENST00000545370 572 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
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MKRN4PQ13434 ERVK-28-203ENST00000600419 457 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
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MKRN4PQ13434 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 MIR376A2-201ENST00000636782 80 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
MKRN4PQ13434 SNORD115-13-201ENST00000363358 82 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
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