Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC243972.3-201ENST00000539655 198 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RNU6-220P-201ENST00000390919 107 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RNA5SP210-201ENST00000391034 120 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 EMCN-202ENST00000305864 1575 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 OSTN-201ENST00000339051 402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
CHAF1AQ13111 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
CHAF1AQ13111 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.6 ms