Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC073869.6-201ENST00000640656 341 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
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CNTN1Q12860 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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CNTN1Q12860 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
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CNTN1Q12860 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
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CNTN1Q12860 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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CNTN1Q12860 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CNTN1Q12860 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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