Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC073544.1-201ENST00000600110 1595 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 INTS6-AS1-201ENST00000434512 466 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC103810.1-201ENST00000579873 453 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 FO393413.1-201ENST00000402892 195 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTPS1P17812 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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