Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 RNA5SP281-201ENST00000516504 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC046143.2-201ENST00000609789 160 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 MTND1P35-201ENST00000526739 508 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC109635.3-201ENST00000529536 185 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC068790.6-201ENST00000602558 258 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.6-201ENST00000362350 114 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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GDE1Q9NZC3 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
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GDE1Q9NZC3 AC117503.1-201ENST00000472241 394 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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GDE1Q9NZC3 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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GDE1Q9NZC3 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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GDE1Q9NZC3 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
GDE1Q9NZC3 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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