Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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PTPRNQ16849 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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PTPRNQ16849 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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PTPRNQ16849 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AC095350.2-201ENST00000544034 201 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
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PTPRNQ16849 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 ORC4-202ENST00000392857 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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PTPRNQ16849 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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PTPRNQ16849 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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PTPRNQ16849 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
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PTPRNQ16849 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
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PTPRNQ16849 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
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PTPRNQ16849 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
PTPRNQ16849 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
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