Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
NCOA1Q15788 MDM2-210ENST00000393413 657 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
NCOA1Q15788 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NCOA1Q15788 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NCOA1Q15788 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NCOA1Q15788 EPGN-208ENST00000509145 222 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
NCOA1Q15788 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.97□□□□□ -2.25
NCOA1Q15788 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NCOA1Q15788 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NCOA1Q15788 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NCOA1Q15788 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
NCOA1Q15788 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 RNU6ATAC4P-201ENST00000387446 126 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC0.96□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.96□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC012467.1-201ENST00000607740 256 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 RNU6-1025P-201ENST00000410629 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 RSL24D1P8-201ENST00000434442 492 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC093875.1-201ENST00000623688 504 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 SERPINI2-209ENST00000616363 1769 ntTSL 5 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC0.94□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 C8orf59-201ENST00000321777 325 ntTSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC0.92□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
NCOA1Q15788 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.9 ms