Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 LINC00216-201ENST00000623548 1126 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RNU6-342P-201ENST00000384521 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC015983.2-201ENST00000446053 472 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC063943.3-201ENST00000615562 356 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 MTCO3P17-201ENST00000443775 513 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RNU6-619P-201ENST00000365146 108 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
HMGN3Q15651 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
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