Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AC039056.2-201ENST00000622261 511 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 CCDC178-204ENST00000403303 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 ADGRL2-210ENST00000370728 6302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 GOT2P5-201ENST00000433995 546 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 SELENOI-201ENST00000260585 8101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
SSPNQ14714 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms