Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

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Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MIR16-1-201ENST00000385271 89 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC010153.1-201ENST00000432862 727 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MTND2P4-201ENST00000445034 1004 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CACNA1CQ13936 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 MTND5P8-201ENST00000449817 1083 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL159990.1-201ENST00000415119 337 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL159990.2-201ENST00000436491 337 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CACNA1CQ13936 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
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