Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 MIR1183-201ENST00000408856 89 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 CACNB4-257ENST00000637547 7658 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 NLGN1-201ENST00000361589 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 ATP13A3-203ENST00000439040 7720 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC5.73□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC5.73□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC5.73□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 OR56A1-203ENST00000641900 8448 ntAPPRIS P1 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RHOT1-204ENST00000394692 2960 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.49
BCANQ96GW7 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BCANQ96GW7 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BCANQ96GW7 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BCANQ96GW7 MIR183-201ENST00000384958 110 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BCANQ96GW7 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BCANQ96GW7 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BCANQ96GW7 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
BCANQ96GW7 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
BCANQ96GW7 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.1 ms