Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 SNORD115.1-201ENST00000391109 76 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 NAALADL2-AS1-201ENST00000426315 804 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
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VAMP3Q15836 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
VAMP3Q15836 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
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VAMP3Q15836 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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VAMP3Q15836 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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VAMP3Q15836 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
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VAMP3Q15836 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC084816.1-207ENST00000538317 584 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC027544.2-201ENST00000539313 630 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
VAMP3Q15836 SEC23A-215ENST00000625395 261 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
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