Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RN7SL807P-201ENST00000470923 297 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RNU1-44P-201ENST00000384453 163 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 SUPT16HP1-201ENST00000537175 3133 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 PHTF2-201ENST00000248550 4778 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC4.11□□□□□ -1.75
CCDC85BQ15834 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
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