Protein–RNA interactions for Protein: Q15257

PTPA, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPAQ15257 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 AL672296.1-201ENST00000427780 2158 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 Y_RNA.276-201ENST00000364732 109 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 MIR622-201ENST00000638396 96 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
PTPAQ15257 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms