Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 OXR1-207ENST00000497705 2007 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AL158837.1-201ENST00000417644 452 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 ZNF28-203ENST00000438150 5171 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AL606845.1-201ENST00000404881 255 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC105137.1-201ENST00000484355 562 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 LINC00276-202ENST00000418420 3503 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CLN3Q13286 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
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