Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 ATP13A4-203ENST00000392443 4016 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
PTPRNQ16849 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 ABCA12-201ENST00000272895 9100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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PTPRNQ16849 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 RNU6-344P-201ENST00000516635 111 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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PTPRNQ16849 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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PTPRNQ16849 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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PTPRNQ16849 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 MYO16-201ENST00000251041 3492 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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PTPRNQ16849 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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PTPRNQ16849 AC010891.1-201ENST00000449963 448 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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PTPRNQ16849 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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PTPRNQ16849 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
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PTPRNQ16849 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
PTPRNQ16849 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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