Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 ERICH3-AS1-202ENST00000612390 4874 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 SCN1A-202ENST00000375405 8097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RTKN2-201ENST00000315289 2383 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 ABCA8-215ENST00000615593 3264 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC090971.4-201ENST00000560291 1800 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 SNORA20B-201ENST00000384220 132 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC025741.1-201ENST00000506100 544 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 CFAP70-203ENST00000355577 3691 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.66
SOBPA7XYQ1 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
SOBPA7XYQ1 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
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