Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMED8-201ENST00000216468 7784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM167B-201ENST00000338272 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 BTBD3-215ENST00000618918 4486 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZBTB34-202ENST00000373452 6528 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 CKAP2L-201ENST00000302450 4533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATG13-203ENST00000524625 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTK2-213ENST00000519465 3279 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 ERLIN2-201ENST00000276461 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-698P-201ENST00000363523 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-34P-201ENST00000364874 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 Y_RNA.354-201ENST00000365448 111 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-913P-201ENST00000390913 95 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL592156.1-201ENST00000508758 304 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 KRT73-AS1-203ENST00000552364 3808 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZFPM2-203ENST00000517361 3300 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 NEDD4L-214ENST00000586263 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 RAI14-208ENST00000506376 3091 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM167A-201ENST00000502346 4630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 PDE4DIP-205ENST00000369354 8262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 XIAP-202ENST00000371199 8591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 IPCEF1-201ENST00000265198 6689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 GABRA1-203ENST00000428797 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAT4-201ENST00000335110 9669 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 TAOK1-202ENST00000536202 4068 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 ONECUT2-202ENST00000491143 16121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 CSMD1-218ENST00000635120 11737 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 CTNND1-219ENST00000528621 5907 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 RPL14-201ENST00000338970 7072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 ESRG-201ENST00000583516 3140 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 USP6-201ENST00000250066 7976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 SCARNA15-201ENST00000607520 4325 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 TLR10-204ENST00000506111 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 UTP14C-201ENST00000521776 5529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF667-202ENST00000504904 4390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 DARS2-201ENST00000361951 3506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 OR6Y1-203ENST00000641622 5128 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 RAI14-205ENST00000503673 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 NHS-204ENST00000615422 8860 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 SRRM1-203ENST00000447431 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 TCL6-206ENST00000467865 3663 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 PHLDB2-207ENST00000477695 5813 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 CEACAM5-202ENST00000398599 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 EYA3-204ENST00000436342 5943 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 TLR7-201ENST00000380659 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 BDNF-206ENST00000395983 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRPM3-203ENST00000358082 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 TRPM3-215ENST00000408909 4701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC24A1-211ENST00000544319 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 CNIH1-201ENST00000216416 4793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNU6-1186P-201ENST00000410429 97 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
KRTAP9-2Q9BYQ4 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms