Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AC112200.1-201ENST00000625015 234 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 GABRG2-202ENST00000361925 3767 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AF064858.2-201ENST00000440714 292 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 SLC4A10-206ENST00000446997 5551 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 ITGB1-205ENST00000423113 3729 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RN7SKP179-201ENST00000516126 217 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
CLN3Q13286 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 PPP2R2B-IT1-201ENST00000505921 447 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 SNORA31.9-201ENST00000516429 84 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AP001328.1-201ENST00000528550 176 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 CYCSP29-201ENST00000533731 318 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC092747.1-201ENST00000538920 351 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 WDR63-203ENST00000370596 2905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
CLN3Q13286 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
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