Protein–RNA interactions for Protein: Q96T88

UHRF1, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UHRF1Q96T88 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 TRAV39-201ENST00000390466 331 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 XIST_intron.1-201ENST00000619444 68 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
UHRF1Q96T88 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 PCAT4-201ENST00000504263 2091 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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UHRF1Q96T88 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 ABCC9-206ENST00000621589 450 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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UHRF1Q96T88 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 LPP-220ENST00000617246 18220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
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UHRF1Q96T88 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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UHRF1Q96T88 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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UHRF1Q96T88 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
UHRF1Q96T88 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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