Protein–RNA interactions for Protein: Q16543

CDC37, Hsp90 co-chaperone Cdc37, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC37Q16543 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDC37Q16543 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CDC37Q16543 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
CDC37Q16543 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.05
CDC37Q16543 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 CLIC4P2-201ENST00000601934 717 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AC027807.2-201ENST00000616099 408 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AC092140.2-201ENST00000618027 521 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 MIR1262-201ENST00000408276 93 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
CDC37Q16543 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 292.4 ms