Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RNU6-245P-201ENST00000384020 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC100770.1-201ENST00000532310 322 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
NR1H3Q13133 LATS1-201ENST00000253339 4256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 ARL15-202ENST00000504924 2486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 ARL15-207ENST00000620747 2486 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 Y_RNA.272-201ENST00000364696 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 HSPE1P12-201ENST00000412576 301 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 ACA59.2-201ENST00000517061 156 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 POLR2B-203ENST00000431623 3666 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 SMAD5-212ENST00000545620 6937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC073308.1-201ENST00000623696 305 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 THOC1-221ENST00000631280 2011 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 Y_RNA.580-201ENST00000391004 95 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 RPS15AP5-201ENST00000436276 388 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AL020998.1-201ENST00000444923 229 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC091179.3-201ENST00000474761 144 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 MIR3690-201ENST00000580266 75 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
NR1H3Q13133 AC091178.1-203ENST00000584586 279 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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