| FLII | Q13045 | RGS4-201 | ENST00000367906 | 930 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | MIR147B-201 | ENST00000390185 | 80 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | RNU2-20P-201 | ENST00000410425 | 191 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | RN7SKP58-201 | ENST00000411010 | 305 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | AL590135.1-201 | ENST00000422215 | 156 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | AC019205.3-201 | ENST00000424573 | 156 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | AL445305.1-201 | ENST00000432577 | 575 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | Z98949.2-201 | ENST00000440996 | 144 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | AC011900.1-201 | ENST00000446838 | 2999 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
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| FLII | Q13045 | Y_RNA.680-201 | ENST00000516441 | 93 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
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| FLII | Q13045 | QSER1-201 | ENST00000399302 | 9335 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | UBE4A-201 | ENST00000252108 | 6103 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | EFR3A-208 | ENST00000637848 | 2547 nt | TSL 5 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | VEPH1-203 | ENST00000392833 | 3979 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | COPS2-202 | ENST00000388901 | 6628 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | OTUD4P1-201 | ENST00000237841 | 3067 nt | BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | CFHR4-202 | ENST00000367416 | 2178 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 5.04 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | FGD4-211 | ENST00000531134 | 2924 nt | TSL 2 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.60-201 | ENST00000362831 | 98 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
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| FLII | Q13045 | RFX3-203 | ENST00000381984 | 364 nt | TSL 3 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | MIR1251-201 | ENST00000408552 | 70 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | SNORA3C-201 | ENST00000408792 | 125 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1140P-201 | ENST00000410517 | 106 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | ARL5AP4-201 | ENST00000430731 | 512 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | AL353748.1-201 | ENST00000440753 | 474 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | AC098587.1-201 | ENST00000508241 | 540 nt | TSL 4 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | AC115990.1-201 | ENST00000526957 | 301 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
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| FLII | Q13045 | MIR4300-201 | ENST00000581016 | 96 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | AC091152.3-201 | ENST00000604227 | 325 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | AC002543.1-201 | ENST00000299783 | 1954 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | CCSER1-201 | ENST00000432775 | 3927 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | AC007256.1-201 | ENST00000392253 | 2765 nt | BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | ORC4-216 | ENST00000540442 | 6472 nt | TSL 2 BASIC | 5.03 | □□□□□ -1.6 | | |
| FLII | Q13045 | RMDN2-205 | ENST00000407257 | 2280 nt | TSL 5 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | NCOA1-201 | ENST00000288599 | 6952 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | U8.10-201 | ENST00000384260 | 133 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-748P-201 | ENST00000384648 | 107 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | MIR215-201 | ENST00000384858 | 110 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | MIR487A-201 | ENST00000385009 | 80 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD115-46-201 | ENST00000390982 | 71 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP252-201 | ENST00000391131 | 119 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1093P-201 | ENST00000391194 | 107 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1203P-201 | ENST00000410703 | 110 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | AL591419.1-201 | ENST00000427423 | 339 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | LINC01969-201 | ENST00000514468 | 455 nt | TSL 3 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | UBL5P4-201 | ENST00000562584 | 236 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | AC136932.1-201 | ENST00000574771 | 208 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | BX546450.2-201 | ENST00000602419 | 435 nt | TSL 5 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | AC012603.1-201 | ENST00000606424 | 528 nt | BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | LINC01206-214 | ENST00000610910 | 456 nt | TSL 5 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | PRPSAP2-229 | ENST00000628609 | 192 nt | TSL 5 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | AJ009632.2-204 | ENST00000635621 | 1401 nt | TSL 5 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | EVI2A-201 | ENST00000247270 | 1860 nt | APPRIS P3 TSL 2 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | LINC01938-201 | ENST00000521341 | 1864 nt | TSL 2 BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | CNOT1-201 | ENST00000317147 | 8471 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.02 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | OTOGL-202 | ENST00000458043 | 8083 nt | APPRIS P5 TSL 5 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | MYCBP2-211 | ENST00000544440 | 14664 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | MS4A1-201 | ENST00000345732 | 3331 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | RNA5SP361-201 | ENST00000362686 | 118 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-318P-201 | ENST00000384283 | 103 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | SNORD12B-201 | ENST00000410433 | 91 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | AC012306.1-201 | ENST00000423267 | 114 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | AC096638.1-201 | ENST00000444678 | 216 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | MTND4LP30-201 | ENST00000454092 | 297 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | AC117462.1-201 | ENST00000461186 | 554 nt | TSL 4 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | RPL31P61-201 | ENST00000496160 | 376 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.673-201 | ENST00000516306 | 88 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-58P-201 | ENST00000517143 | 103 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | LINC00944-201 | ENST00000536517 | 421 nt | TSL 2 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | AC073657.2-201 | ENST00000605661 | 303 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | AL442067.1-201 | ENST00000613261 | 223 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | MESTIT1_1.1-201 | ENST00000618871 | 140 nt | BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | AL591441.1-201 | ENST00000618108 | 2247 nt | TSL 2 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | BBX-203 | ENST00000402543 | 3980 nt | TSL 5 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | CYYR1-AS1-201 | ENST00000357401 | 3412 nt | TSL 2 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | VPS13C-202 | ENST00000261517 | 13400 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | LINC00648-202 | ENST00000555985 | 2885 nt | TSL 2 BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | UTP20-201 | ENST00000261637 | 9025 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.01 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | AC010889.1-201 | ENST00000566193 | 2666 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | CFTR-201 | ENST00000003084 | 6132 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | RNU4-56P-201 | ENST00000364700 | 142 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | RNU1-64P-201 | ENST00000365443 | 163 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-937P-201 | ENST00000384325 | 106 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | MIR513A2-201 | ENST00000385249 | 127 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | PTMAP5-201 | ENST00000393073 | 333 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | SNAP23-203 | ENST00000397138 | 477 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | Y_RNA.602-201 | ENST00000410535 | 92 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | AC012081.1-201 | ENST00000462382 | 477 nt | TSL 3 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | AC117394.2-201 | ENST00000487827 | 323 nt | TSL 3 BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | RNU6-1023P-201 | ENST00000516137 | 106 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |
| FLII | Q13045 | RNU5B-3P-201 | ENST00000516601 | 115 nt | BASIC | 5 | □□□□□ -1.61 | | |