Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL109947.1-201ENST00000423747 382 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CSTF3Q12996 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 Y_RNA.100-201ENST00000363141 102 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CSTF3Q12996 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
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