Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.47
CENPEQ02224 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.41□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 LINC01337-201ENST00000515871 440 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 AC097491.1-201ENST00000507857 672 ntTSL 5 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 RN7SKP5-201ENST00000517045 272 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC-0.43□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 Y_RNA.403-201ENST00000383977 101 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC-0.44□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
CENPEQ02224 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.44□□□□□ -2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms