Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 MIR208B-201ENST00000401172 77 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 HMGN2P27-201ENST00000427352 270 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 ASAH2-201ENST00000329428 2184 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC106871.1-201ENST00000568324 3102 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC099548.1-201ENST00000421443 426 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC011603.4-201ENST00000611325 277 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 RDM1-215ENST00000612980 501 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 SPOCK3-225ENST00000535728 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 OBSCN-214ENST00000636875 23907 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 SMG1P1-206ENST00000431681 2913 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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HOXA2O43364 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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HOXA2O43364 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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HOXA2O43364 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC107068.1-201ENST00000563286 4218 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
HOXA2O43364 AC006461.1-201ENST00000412637 326 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
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