Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLCH1-203ENST00000447496 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMOD2-201ENST00000249700 9191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 OAS2-201ENST00000342315 3613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092070.2-203ENST00000598377 3644 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LZTFL1-215ENST00000536047 4342 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDZD2-202ENST00000438447 11704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RIF1-201ENST00000243326 15003 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFAP57-208ENST00000610710 4162 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL1RAPL1-202ENST00000378993 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFYVE16-206ENST00000510158 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA32-201ENST00000384072 121 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM183AP1-205ENST00000432739 290 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 STAG1-201ENST00000236698 5951 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 APOL4-203ENST00000352371 3227 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CFAP221-203ENST00000413369 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RTTN-222ENST00000640769 8088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 NFAT5-201ENST00000349945 13362 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SORCS1-210ENST00000622431 6701 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LRRC37A16P-202ENST00000586022 3725 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL37A-210ENST00000491306 3647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RBPJ-202ENST00000342320 5761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
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KRTAP9-3Q9BYQ3 HIVEP2-202ENST00000367603 9724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRPS1-212ENST00000640765 9514 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPN3-203ENST00000412145 8765 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA22.1-201ENST00000362701 134 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU6-865P-201ENST00000364772 107 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
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