Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FXNQ16595 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FXNQ16595 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FXNQ16595 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FXNQ16595 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FXNQ16595 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FXNQ16595 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
FXNQ16595 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FXNQ16595 MIR4284-201ENST00000578924 81 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FXNQ16595 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
FXNQ16595 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
FXNQ16595 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.8
FXNQ16595 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AL353743.1-202ENST00000431724 1695 ntBASIC3.84□□□□□ -1.8
FXNQ16595 ANKRD28-215ENST00000624145 6383 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FXNQ16595 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FXNQ16595 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FXNQ16595 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FXNQ16595 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FXNQ16595 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FXNQ16595 U3.22-201ENST00000391120 215 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FXNQ16595 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FXNQ16595 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FXNQ16595 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FXNQ16595 RN7SL810P-201ENST00000493031 276 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FXNQ16595 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FXNQ16595 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
FXNQ16595 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FXNQ16595 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
FXNQ16595 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AC099778.2-201ENST00000610904 211 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AC091903.1-201ENST00000624322 454 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 PTPN22-211ENST00000538253 3575 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
FXNQ16595 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
FXNQ16595 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.1 ms