Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNU2-33P-201ENST00000410344 192 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 ZNF706-202ENST00000517844 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AL356124.2-201ENST00000442449 391 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNU6-927P-201ENST00000516199 100 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 BNIP3P9-201ENST00000603714 553 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 ZNF705D-201ENST00000400078 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AL139397.2-201ENST00000404529 772 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHD4Q14839 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.8 ms