Protein–RNA interactions for Protein: Q13442

PDAP1, 28 kDa heat- and acid-stable phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDAP1Q13442 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 AC019117.3-201ENST00000637807 3523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 CKAP2-207ENST00000490903 3395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 MIR551A-201ENST00000385042 96 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 ITCH-IT1-201ENST00000418598 208 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 AC007161.1-204ENST00000423039 460 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 DCN-206ENST00000456569 228 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 AL513314.2-201ENST00000621440 545 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 5S_rRNA.13-201ENST00000622298 123 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 CCDC25-212ENST00000640944 261 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 MUC2-202ENST00000613187 4845 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 AC125257.1-201ENST00000560400 2930 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 DPP8-210ENST00000559233 2953 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 AC083899.1-201ENST00000454465 3819 ntBASIC5.46□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.53
PDAP1Q13442 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 RNU7-57P-201ENST00000459540 60 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 SNORA43.3-201ENST00000517240 103 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 AP005431.1-201ENST00000618479 319 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 PATL1-201ENST00000300146 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
PDAP1Q13442 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.7 ms