Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL008629.1-201ENST00000438615 184 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU2-53P-201ENST00000516257 147 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL157955.1-201ENST00000554433 331 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL158834.1-201ENST00000419441 466 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 Y_RNA.116-201ENST00000363292 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SRSF5Q13243 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
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