Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 EHBP1-202ENST00000405015 4108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 PCDH15-211ENST00000395440 3177 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RNU6-335P-201ENST00000364563 113 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 ARHGAP42-201ENST00000298815 4752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 ELOCP21-201ENST00000412558 336 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC005699.1-205ENST00000510639 427 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 UTS2-201ENST00000054668 420 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 LINC02017-201ENST00000496829 474 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
NFX1Q12986 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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