Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 MAPK10-206ENST00000395161 4186 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
SOBPA7XYQ1 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 CAST-201ENST00000309190 4282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 LYST-202ENST00000389794 12985 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 SNORD116-21-201ENST00000384507 92 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 POSTN-210ENST00000541481 3113 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC092650.1-201ENST00000447571 1808 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 WDR35-202ENST00000345530 6960 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RN7SKP280-201ENST00000364196 304 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 CKS1BP6-201ENST00000424932 240 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC105940.1-201ENST00000434265 353 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AL157756.1-201ENST00000532515 2859 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 PCDH15-209ENST00000395433 6942 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RNU6-537P-201ENST00000517277 103 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SOBPA7XYQ1 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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