Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ARFGEF1Q9Y6D6 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ARFGEF1Q9Y6D6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms