Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GTF3C3Q9Y5Q9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms