Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
THRAP3Q9Y2W1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
THRAP3Q9Y2W1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
THRAP3Q9Y2W1 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
THRAP3Q9Y2W1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
THRAP3Q9Y2W1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THRAP3Q9Y2W1 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms