Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T6

GPR55, G-protein coupled receptor 55, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR55Q9Y2T6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GPR55Q9Y2T6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms