Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y256

RCE1, CAAX prenyl protease 2, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCE1Q9Y256 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RCE1Q9Y256 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RCE1Q9Y256 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms