Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
THSD7AQ9UPZ6 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
THSD7AQ9UPZ6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms