Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
IGSF9BQ9UPX0 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
IGSF9BQ9UPX0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms