Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPS6

SETD1B, Histone-lysine N-methyltransferase SETD1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD1BQ9UPS6 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SETD1BQ9UPS6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SETD1BQ9UPS6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms