Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
INO80Q9ULG1 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
INO80Q9ULG1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
INO80Q9ULG1 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms