Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HDAC9Q9UKV0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HDAC9Q9UKV0 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms