Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA8

RCAN3, Calcipressin-3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCAN3Q9UKA8 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCAN3Q9UKA8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCAN3Q9UKA8 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms