Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
KDM5BQ9UGL1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
KDM5BQ9UGL1 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms